1、水分调节。由于不同地区、不同品种，原料有干、有硬、有湿软，经过清理后要进行水分调节，要把原料达到合适的水分含量。这样做的目的就是，小麦吸收定量水分以后，更加容易进行破碎、进入石磨面粉机组以后更加容易进行研磨。再者就是表皮吸水变韧，研磨时不容易破碎等。
2、润麦。润麦的含义就是经过水分调节以后的原料静置段时间，主要是为了让小麦的水分向麦粒中进行渗透，同时让整个小麦间的水分达到平衡，使麦粒的皮层与胚乳易于分离开来，可使石磨面粉机组的加工情况更加良好，加工出来的面粉粉质更佳。再者就是小麦的润麦时间，般为30—48小时，小麦的含水量在13-14.5%。
3、研磨与过筛。小麦的研磨是个重复的工作，石磨面粉机组本身的转速很低，压力相比于机械磨的要小，避免了高速旋转破坏了小麦的生物活性，保留了小麦中的活性物质。因此，石磨面的口感较佳，麦香味更加浓郁，营养价值高，是绿色的健康食品。
此外，还要注意清理环节，主要就是清理原料中的各种杂质，石子、沙尘、破损麦等等目的就是为了不让这些杂质影响面粉的出粉质量。
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